%0 Journal Article %T Evaluation of the Bio-Evolution Microsporidia generic and typing real-time PCR assays for the diagnosis of intestinal microsporidiosis %T Evaluation des tests de PCR en temps reel Bio-Evolution Microsporidia generic et typing pour le diagnostic de la microsporidiose intestinale. %+ Laboratoire de Parasitologie et Mycologie [CHU Clermont-Ferrand] %+ Infection Inflammation et Interaction Hôtes Pathogènes [CHU Clermont-Ferrand] (3IHP ) %+ Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH) %+ Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294 (AGIR ) %+ AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] %+ Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261) %+ CHU Caen %+ Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements (ABTE) %+ Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle] %+ Unité de Parasitologie-Mycologie [Créteil] %+ Dynamic Microbiology - EA 7380 (DYNAMIC) %+ Stress, Immunité, Pathogènes (SIMPA) %+ Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy) %+ Laboratoire de Microbiologie Clinique [AP-HP Hôpital Necker-Enfants Malades] %+ Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E) %+ Laboratoire de Parasitologie et de Mycologie Médicale [Strasbourg] %+ Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM) %+ Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon) %+ Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle (ESCAPE) %A Moniot, Maxime %A Nourrisson, Céline %A Bonnin, Virginie %A Damiani, Céline %A Argy, Nicolas %A Bonhomme, Julie %A Fréalle, Emilie %A Angebault, Cécile %A Debourgogne, Anne %A Emilie, Sitterle %A Flori, Pierre %A Brunet, Julie %A Dalle, Frédéric %A Favennec, Loïc %A Poirier, Philippe %A Microsporidiosis Network, French %Z "Direction de la Recherche Clinique et de l'Innovation (DRCI)" of the Clermont-Ferrand University Hospital %< avec comité de lecture %@ 1252-607X %J Parasite %I EDP Sciences %V 29 %N 55 %P 1-8 %8 2022 %D 2022 %R 10.1051/parasite/2022055 %M 36426934 %K Bio-Evolution %K Encephalitozoon intestinalis %K Enterocytozoon bieneusi %K Microsporidiosis %K Real-time PCR %Z Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology %Z Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/ParasitologyJournal articles %X Cases of intestinal microsporidiosis infection are underestimated and affect both immunocompromized and immunocompetent patients. Real-time PCR is superseding microscopic examination for its diagnosis in medical analysis laboratories. However, few manufacturers include microsporidia in their PCR panel for the diagnosis of infectious gastroenteritis. Here, we evaluated the performances of the real-time PCR assays microsporidia generic and microsporidia typing (Bio-Evolution, France) on the Rotor-Gene Q real-time PCR cycler (Qiagen, France). We included 45 negative and 44 positive stool samples for Enterocytozoon bieneusi ( n = 34, with various genotypes), Encephalitozoon intestinalis ( n = 4), Encephalitozoon hellem ( n = 4), and Encephalitozoon cuniculi ( n = 2). We also studied a four-year survey of an inter-laboratory quality control program including 9 centers that used this commercial assay. Sensitivity and specificity of the microsporidia generic assay were 86.4% and 93.3%, respectively. Encephalitozoon hellem and Encephalitozoon cuniculi were detected by the microsporidia generic PCR assay but not by the microsporidia typing PCR assay. These results were consistent with the results of the inter-laboratory quality control program. In conclusion, Bio-Evolution Real-time PCR assays are useful tools for intestinal microsporidiosis, but negative results for microsporidia typing assays require supplementary analyses to confirm E. hellem or E. cuniculi infections. %X Les microsporidioses intestinales sont des infections sous-estimées affectant à la fois les patients immunodéprimés et immunocompétents. Le diagnostic microscopique en laboratoire médical est aujourd’hui supplanté par la PCR en temps réel. Cependant, peu de fabricants incluent les microsporidies dans leurs panels PCR pour le diagnostic des gastro-entérites infectieuses. Ici, nous avons évalué les performances des tests PCR en temps réel microsporidia generic et microsporidia typing (Bio-Evolution, France) sur le thermocycleur PCR en temps réel Rotor-Gene Q (Qiagen, France). Nous avons inclus 45 échantillons de selles négatifs et 44 échantillons positifs pour Enterocytozoon bieneusi ( n = 34, avec divers génotypes), Encephalitozoon intestinalis ( n = 4), Encephalitozoon hellem ( n = 4) et Encephalitozoon cuniculi ( n = 2). Nous avons également analysé les résultats sur 4 ans d’un programme de contrôle qualité inter-laboratoires dont 9 centres ont utilisé ces kits commerciaux. La sensibilité et la spécificité du kit microsporidia generic étaient respectivement de 86,4 % et 93,3 %. Encephalitozoon hellem et E. cuniculi ont été détectés par le kit microsporidia generic mais pas par le kit microsporidia typing. Ces résultats étaient cohérents avec ceux du programme de contrôle de qualité inter-laboratoires. En conclusion, les tests de PCR en temps réel Bio-Evolution sont des outils intéressants pour la microsporidiose intestinale, mais un résultat négatif pour le test de typage microsporidia nécessite une analyse supplémentaire pour confirmer les infections à E. hellem ou E. cuniculi . %G English %L hal-03881459 %U https://u-picardie.hal.science/hal-03881459 %~ ANSES %~ UNIV-BOURGOGNE %~ PRES_CLERMONT %~ UNIV-PICARDIE %~ URCA %~ APHP %~ UPEC %~ COMUE-NORMANDIE %~ UNIV-LORRAINE %~ PAM %~ M2ISH %~ AGREENIUM %~ SIMPA-UL %~ ESCAPE-REIMS %~ UNIROUEN %~ UNICAEN %~ CHU-UNIV-PARIS5 %~ ESCAPE-ROUEN %~ ENVA %~ CHU-CLERMONTFERRAND %~ ABTE %~ INRAE %~ UNIV-PARIS %~ UNIVERSITE-PARIS %~ UP-SANTE %~ DYNAMIC %~ BMS-UL %~ U-PICARDIE %~ AGIR-UPJV %~ MICA-UNITES %~ INSTITUT-AGRO