Genotypic and phenotypic characterisation of respiratory syncytial virus after nirsevimab breakthrough infections: a large, multicentre, observational, real-world study
Slim Fourati
(1, 2)
,
Alawiya Reslan
(3)
,
Jérome Bourret
(4, 5)
,
Jean-Sébastien Casalegno
(6, 7, 8, 9, 10)
,
Yannis Rahou
(4, 11)
,
Lionel Chollet
(12)
,
Sylvie Pillet
(13)
,
Pauline Tremeaux
(14)
,
Nefert Candace Dossou
(15)
,
Elyanne Gault
(16)
,
Maud Salmona
(17)
,
Berthe-Marie Imbert-Marcille
(18, 19, 20, 21)
,
Audrey Mirand
(22, 23)
,
Sylvie Larrat
(24)
,
Alice Moisan
(25)
,
Stéphane Marot
(26)
,
Aurélie Schnuriger
(27, 28)
,
Nicolas Veyrenche
(29, 30)
,
Ilka Engelmann
(31, 32)
,
Lynda Handala
(33, 34)
,
Amandine Henry
(35)
,
Valentin Stephan
(36)
,
Ségolène Brichler
(37, 38)
,
Véronique Avettand-Fenoel
(39)
,
Nael Zemali
(40)
,
Caroline Lefeuvre
(41)
,
Charlotte Pronier
(42)
,
Luc Deroche
(43, 44, 45)
,
Marie-Christine Jaffar-Bandjee
(46)
,
Lina Mouna
(47, 48)
,
Catherine Francois
(49, 50)
,
Alexandre Regueme
(31)
,
Cédric Hartard
(51, 52)
,
Sylvie Rogez
(53)
,
Floriane Gallais
(54)
,
Arnaud Ly
,
Christophe Rodriguez
(38, 55, 56, 57)
,
Georges dos Santos
(29)
,
Etienne Simon-Loriere
(58)
,
Olivier Schwartz
(59, 60)
,
Julian Buchrieser
(59)
,
Jean-Miichel Pawlotsky
,
Frédéric Lemoine
(61)
,
Etienne Audureau
(1, 62)
,
Marie-Anne Rameix-Welti
(11, 63, 64, 65, 66)
,
Naël Zemali
(40)
,
Sonia Burrel
(67, 68, 69)
,
Alice Moisan
(25)
,
Zakasoa-Mbololona Zavaoarisaina
,
Romain Legros
(70)
,
Boris Derman
(71)
,
Vincent Pargny
(70)
,
Hortense Petat
(25, 72)
,
Jean-Christophe Plantier
(25, 71)
,
Véronique Avettand-Fenoel
(39)
,
Salim Ferrani
,
Jérome Guinard
(73)
,
Clémence Guillaume
(74)
,
Gilbert Mchantaf
,
Victoria Marie
,
Laurent Bret
,
Fabien Lesne
,
Anthony de Oliveira
,
Alexandre Regueme
,
Kazali Alidjinou
,
Lionel Chollet
,
Vincent Gardan
,
Ségolène Brichler
,
Loic de Pontual
,
Camille Aupiais
,
Stéphane Marot
,
Aurélie Schnuriger
,
Marine Perrier
,
Pierre Jatteau
,
Djeneba Fofana
,
Théophile Cocherie
,
Elisa Teyssou
,
Cathia Soulié
,
Vincent Calvez
,
Sylvie Larrat
,
Anne Faisant
,
Guillaume Mortamet
,
Caroline Tournegros
,
Mohamed Habib
,
Sylvie Pillet
,
Aymeric Cantais
,
Franck Zekre
,
Thomas Bourlet
,
Oulfa Boussetta-Charfi
,
Sara Chenafi-Adham
,
Eva Gleizes
,
Cédric Hartard
,
Caroline Lefeuvre
,
Elise Bouthry
,
Lina Mouna
,
Fairly Warnakulasuriya
,
Quentin Le Hingrat
,
Marie-Christine Jaffar
,
Diana Heaugwane
,
Benjamin Azemar
,
Nicolas Mnemosyme
,
Laurent Souply
,
Sandrine Castelain
(49, 50)
,
Cinthia Rames
,
Arnaud Bécourt
,
Ilka Engelmann
,
Eric Jeziorski
,
Vincent Foulongne
,
Steven Henry
,
Léa Domitien
,
Lynda Handala
(33)
,
Catherine Gaudy-Graffin
,
Agathe Crémadés
,
Amandine Henry
,
Alessandra Pennisi
,
Maud Salmona
,
Jérôme Le Goff
,
Sarah Mafi
,
Audrey Gabassi
,
Marie-Laure Néré
,
Naim Ouldali
,
Stéphane Bonacorsi
,
Marie-Anne Rameix-Welti
,
Senhaji Rachik Abdeljalil
,
Alawyia Reslan
,
Yannis Rahou
,
Jérome Bourret
,
Frédérique Lemoine
,
Kévin da Silva
,
Samar Berreira Ibraim
,
Emilie Yab
,
Vincent Enouf
,
Flora Donati
,
Matthieu Prot
,
Banujaa Jeyarajah
,
Etienne Simon-Loriere
,
Nefert Candace Dossou
,
Astrid Vabret
,
Slim Fourati
,
Christophe Rodriguez
,
Jean-Michel Pawlotsky
,
Pierre Cappy
,
Alexandre Soulier
,
Mohamed Ader
,
Sarah Seng
,
Arnaud Ly
,
Pierre-André Natella
,
Etienne Audureau
,
Georges dos Santos
,
Laurence Fagour
,
Anne-Julie Schapira
,
Olivier Flechelles
,
Luc Deroche
,
Nicolas Leveque
,
Claire Morton Fauche
,
Berthe-Marie Imbert
,
Louise Castain
,
Audreay Rodallec
,
Justine Sourice
,
Christele Gras-Le Guen
,
Anne Chauvire-Drouard
,
Elyanne Gault
,
Frédérique Moreau
,
Claire Deback
,
Floriane Gallais
,
Morgane Solis
,
Valentin Stephan
,
Léa Pilorgé
,
Sophie Vallet
,
Léa Gaitan
,
Sylvie Rogez
,
Audrey Mirand
,
Cecile Henquell
,
Charlotte Pronier
,
Vincent Thibault
,
Pauline Trémeaux
,
Isabelle Claudet
,
Mélanie Pucelle
,
Laetitia Staes
,
Camille Vellas
,
Romain Carcenac
,
Nicolas Veyrenche
,
Jean-Sébastien Casalegno
,
Alexandre Gaymard
,
Jose Kombou
,
Antonin Bal
,
Stanislas Ogoudjobi
1
Hôpital Henri Mondor
2 UPEC UP12 - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12
3 PIMIT - Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical
4 GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2) - Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses
5 CNR - laboratoire coordonnateur - Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae [Paris]
6 IAI - Institut des Agents Infectieux [Lyon]
7 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
8 CNR - laboratoire coordonnateur - Centre National de Référence des virus respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV2) [Lyon]
9 Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL]
10 CIRI - Centre International de Recherche en Infectiologie
11 CNR - laboratoire associé - Centre National de Référence des virus respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV2) [Paris]
12 Centre Hospitalier Intercommunal de Toulon [La Seyne-sur-Mer]
13 Service des Agents Infectieux et Hygiène [CHU Saint-Etienne]
14 Laboratoire Virologie [CHU Toulouse]
15 UNICAEN Santé - Université de Caen Normandie - UFR Santé
16 Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
17 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
18 Service de virologie [CHU Nantes]
19 U1064 Inserm - CR2TI - Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology
20 Team 1 - U1064 Inserm - CR2TI - Team 1 : Mononuclear phagocytes, Immunopathology, Immunovirology
21 ITERT - Institut de Transplantation et de Recherche en Transplantation [CHU Nantes]
22 CHU Clermont-Ferrand
23 UCA - Université Clermont Auvergne
24 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
25 DYNAMICURE - Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires
26 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
27 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
28 CHU Trousseau [APHP]
29 PCCEI - Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections
30 CHU Montpellier = Montpellier University Hospital
31 Laboratoire de Virologie - Laboratoire de Virologie - ULR 3610
32 UM - Université de Montpellier
33 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
34 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
35 Centre Hospitalier Victor Dupouy
36 Alcatel Lucent Bell Labs
37 Hôpital Avicenne [AP-HP]
38 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
39 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
40 Laboratoire de Bactériologie, Virologie et Parasitologie [Saint-Pierre, La Réunion]
41 HIFIH - Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques
42 Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou]
43 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
44 PHAR2 [Poitiers] - Pharmacologie des anti-infectieux et antibiorésistance [U 1070]
45 UFR Santé [Poitiers] - Université de Poitiers – UFR Santé [Faculté de Médecine et de Pharmacie]
46 CHU La Réunion - Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion
47 Physiopathologie et traitement des maladies du foie
48 World Health Organization Rubella National Reference Laboratory - Service de Virologie [Hôpital Paul-Brousse - APHP]
49 CHU Amiens-Picardie
50 AGIR - Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
51 LCPME - Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement
52 Service de Virologie [CHRU Nancy]
53 Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
54 HUS - Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
55 U955 Inserm - UPEC - IMRB - VHC/"Viruses-Hepatology-Cancers" [Créteil]
56 U955 Inserm - UPEC - IMRB - PROTECT/"Pharmacologie et Technologies pour les Maladies Cardiovasculaires" [Créteil]
57 Hôpital Henri Mondor
58 Génomique évolutive des virus à ARN - Evolutionary genomics of RNA viruses
59 CNRS-UMR3569 - Virus et Immunité - Virus and immunity
60 VRI - Vaccine Research Institute [Créteil, France]
61 Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB
62 U955 Inserm - UPEC - IMRB - CEPIA/"Clinical Epidemiology And Ageing : Geriatrics, Primary Care and Public Health" [Créteil]
63 M3P - Mécanismes moléculaires de la multiplication des Pneumovirus / Molecular mechanisms of multiplication of Pneumoviruses
64 2I - Infection et inflammation
65 Université Paris-Saclay
66 AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
67 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
68 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
69 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
70 UNIROUEN UFR Santé - UNIROUEN - UFR Santé
71 Laboratoire de virologie [Rouen]
72 CHU Rouen
73 CHRO - Centre Hospitalier Régional d'Orléans
74 CeReS - Centre de Recherches Sémiotiques
2 UPEC UP12 - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12
3 PIMIT - Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical
4 GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2) - Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses
5 CNR - laboratoire coordonnateur - Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae [Paris]
6 IAI - Institut des Agents Infectieux [Lyon]
7 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
8 CNR - laboratoire coordonnateur - Centre National de Référence des virus respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV2) [Lyon]
9 Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL]
10 CIRI - Centre International de Recherche en Infectiologie
11 CNR - laboratoire associé - Centre National de Référence des virus respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV2) [Paris]
12 Centre Hospitalier Intercommunal de Toulon [La Seyne-sur-Mer]
13 Service des Agents Infectieux et Hygiène [CHU Saint-Etienne]
14 Laboratoire Virologie [CHU Toulouse]
15 UNICAEN Santé - Université de Caen Normandie - UFR Santé
16 Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
17 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
18 Service de virologie [CHU Nantes]
19 U1064 Inserm - CR2TI - Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology
20 Team 1 - U1064 Inserm - CR2TI - Team 1 : Mononuclear phagocytes, Immunopathology, Immunovirology
21 ITERT - Institut de Transplantation et de Recherche en Transplantation [CHU Nantes]
22 CHU Clermont-Ferrand
23 UCA - Université Clermont Auvergne
24 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
25 DYNAMICURE - Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires
26 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
27 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
28 CHU Trousseau [APHP]
29 PCCEI - Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections
30 CHU Montpellier = Montpellier University Hospital
31 Laboratoire de Virologie - Laboratoire de Virologie - ULR 3610
32 UM - Université de Montpellier
33 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
34 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
35 Centre Hospitalier Victor Dupouy
36 Alcatel Lucent Bell Labs
37 Hôpital Avicenne [AP-HP]
38 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
39 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
40 Laboratoire de Bactériologie, Virologie et Parasitologie [Saint-Pierre, La Réunion]
41 HIFIH - Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques
42 Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou]
43 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
44 PHAR2 [Poitiers] - Pharmacologie des anti-infectieux et antibiorésistance [U 1070]
45 UFR Santé [Poitiers] - Université de Poitiers – UFR Santé [Faculté de Médecine et de Pharmacie]
46 CHU La Réunion - Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion
47 Physiopathologie et traitement des maladies du foie
48 World Health Organization Rubella National Reference Laboratory - Service de Virologie [Hôpital Paul-Brousse - APHP]
49 CHU Amiens-Picardie
50 AGIR - Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
51 LCPME - Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement
52 Service de Virologie [CHRU Nancy]
53 Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
54 HUS - Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
55 U955 Inserm - UPEC - IMRB - VHC/"Viruses-Hepatology-Cancers" [Créteil]
56 U955 Inserm - UPEC - IMRB - PROTECT/"Pharmacologie et Technologies pour les Maladies Cardiovasculaires" [Créteil]
57 Hôpital Henri Mondor
58 Génomique évolutive des virus à ARN - Evolutionary genomics of RNA viruses
59 CNRS-UMR3569 - Virus et Immunité - Virus and immunity
60 VRI - Vaccine Research Institute [Créteil, France]
61 Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB
62 U955 Inserm - UPEC - IMRB - CEPIA/"Clinical Epidemiology And Ageing : Geriatrics, Primary Care and Public Health" [Créteil]
63 M3P - Mécanismes moléculaires de la multiplication des Pneumovirus / Molecular mechanisms of multiplication of Pneumoviruses
64 2I - Infection et inflammation
65 Université Paris-Saclay
66 AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
67 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
68 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
69 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
70 UNIROUEN UFR Santé - UNIROUEN - UFR Santé
71 Laboratoire de virologie [Rouen]
72 CHU Rouen
73 CHRO - Centre Hospitalier Régional d'Orléans
74 CeReS - Centre de Recherches Sémiotiques
Berthe-Marie Imbert-Marcille
- Fonction : Auteur
Ségolène Brichler
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1369545
- ORCID : 0000-0002-7336-7730
Arnaud Ly
- Fonction : Auteur
Jean-Miichel Pawlotsky
- Fonction : Auteur
Marie-Anne Rameix-Welti
- Fonction : Auteur
Zakasoa-Mbololona Zavaoarisaina
- Fonction : Auteur
Salim Ferrani
- Fonction : Auteur
Gilbert Mchantaf
- Fonction : Auteur
Victoria Marie
- Fonction : Auteur
Laurent Bret
- Fonction : Auteur
Fabien Lesne
- Fonction : Auteur
Anthony de Oliveira
- Fonction : Auteur
Alexandre Regueme
- Fonction : Auteur
Kazali Alidjinou
- Fonction : Auteur
Lionel Chollet
- Fonction : Auteur
Vincent Gardan
- Fonction : Auteur
Ségolène Brichler
- Fonction : Auteur
Loic de Pontual
- Fonction : Auteur
Camille Aupiais
- Fonction : Auteur
Stéphane Marot
- Fonction : Auteur
Aurélie Schnuriger
- Fonction : Auteur
Marine Perrier
- Fonction : Auteur
Pierre Jatteau
- Fonction : Auteur
Djeneba Fofana
- Fonction : Auteur
Théophile Cocherie
- Fonction : Auteur
Elisa Teyssou
- Fonction : Auteur
Cathia Soulié
- Fonction : Auteur
- PersonId : 8821
- IdHAL : cathia-soulie
- ORCID : 0009-0008-2032-4148
- IdRef : 248691570
Vincent Calvez
- Fonction : Auteur
Sylvie Larrat
- Fonction : Auteur
Anne Faisant
- Fonction : Auteur
Guillaume Mortamet
- Fonction : Auteur
Caroline Tournegros
- Fonction : Auteur
Mohamed Habib
- Fonction : Auteur
Sylvie Pillet
- Fonction : Auteur
Aymeric Cantais
- Fonction : Auteur
Franck Zekre
- Fonction : Auteur
Thomas Bourlet
- Fonction : Auteur
Oulfa Boussetta-Charfi
- Fonction : Auteur
Sara Chenafi-Adham
- Fonction : Auteur
Eva Gleizes
- Fonction : Auteur
Cédric Hartard
- Fonction : Auteur
Caroline Lefeuvre
- Fonction : Auteur
Elise Bouthry
- Fonction : Auteur
Lina Mouna
- Fonction : Auteur
Fairly Warnakulasuriya
- Fonction : Auteur
Quentin Le Hingrat
- Fonction : Auteur
Marie-Christine Jaffar
- Fonction : Auteur
Diana Heaugwane
- Fonction : Auteur
Benjamin Azemar
- Fonction : Auteur
Nicolas Mnemosyme
- Fonction : Auteur
Laurent Souply
- Fonction : Auteur
Sandrine Castelain
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 1130623
- IdHAL : sandrine-castelain
- ORCID : 0000-0002-2670-3148
- IdRef : 273919245
Cinthia Rames
- Fonction : Auteur
Arnaud Bécourt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1419018
- IdRef : 18322809X
Ilka Engelmann
- Fonction : Auteur
Eric Jeziorski
- Fonction : Auteur
Vincent Foulongne
- Fonction : Auteur
Steven Henry
- Fonction : Auteur
Léa Domitien
- Fonction : Auteur
Lynda Handala
- Fonction : Auteur
- PersonId : 794019
- ORCID : 0000-0001-5033-4357
- IdRef : 228521971
Catherine Gaudy-Graffin
- Fonction : Auteur
Agathe Crémadés
- Fonction : Auteur
Amandine Henry
- Fonction : Auteur
Alessandra Pennisi
- Fonction : Auteur
Maud Salmona
- Fonction : Auteur
Jérôme Le Goff
- Fonction : Auteur
Sarah Mafi
- Fonction : Auteur
Audrey Gabassi
- Fonction : Auteur
Marie-Laure Néré
- Fonction : Auteur
Naim Ouldali
- Fonction : Auteur
Stéphane Bonacorsi
- Fonction : Auteur
Marie-Anne Rameix-Welti
- Fonction : Auteur
Senhaji Rachik Abdeljalil
- Fonction : Auteur
Alawyia Reslan
- Fonction : Auteur
Yannis Rahou
- Fonction : Auteur
Jérome Bourret
- Fonction : Auteur
Frédérique Lemoine
- Fonction : Auteur
Kévin da Silva
- Fonction : Auteur
Samar Berreira Ibraim
- Fonction : Auteur
Emilie Yab
- Fonction : Auteur
Vincent Enouf
- Fonction : Auteur
Flora Donati
- Fonction : Auteur
Matthieu Prot
- Fonction : Auteur
Banujaa Jeyarajah
- Fonction : Auteur
Etienne Simon-Loriere
- Fonction : Auteur
Nefert Candace Dossou
- Fonction : Auteur
Astrid Vabret
- Fonction : Auteur
Slim Fourati
- Fonction : Auteur
Christophe Rodriguez
- Fonction : Auteur
Jean-Michel Pawlotsky
- Fonction : Auteur
Pierre Cappy
- Fonction : Auteur
Alexandre Soulier
- Fonction : Auteur
Mohamed Ader
- Fonction : Auteur
Sarah Seng
- Fonction : Auteur
Arnaud Ly
- Fonction : Auteur
Pierre-André Natella
- Fonction : Auteur
Etienne Audureau
- Fonction : Auteur
Georges dos Santos
- Fonction : Auteur
Laurence Fagour
- Fonction : Auteur
Anne-Julie Schapira
- Fonction : Auteur
Olivier Flechelles
- Fonction : Auteur
Luc Deroche
- Fonction : Auteur
Nicolas Leveque
- Fonction : Auteur
Claire Morton Fauche
- Fonction : Auteur
Berthe-Marie Imbert
- Fonction : Auteur
Louise Castain
- Fonction : Auteur
Audreay Rodallec
- Fonction : Auteur
Justine Sourice
- Fonction : Auteur
Christele Gras-Le Guen
- Fonction : Auteur
Anne Chauvire-Drouard
- Fonction : Auteur
Elyanne Gault
- Fonction : Auteur
Frédérique Moreau
- Fonction : Auteur
Claire Deback
- Fonction : Auteur
Floriane Gallais
- Fonction : Auteur
Morgane Solis
- Fonction : Auteur
Valentin Stephan
- Fonction : Auteur
Léa Pilorgé
- Fonction : Auteur
Sophie Vallet
- Fonction : Auteur
Léa Gaitan
- Fonction : Auteur
Sylvie Rogez
- Fonction : Auteur
Audrey Mirand
- Fonction : Auteur
Cecile Henquell
- Fonction : Auteur
Charlotte Pronier
- Fonction : Auteur
Vincent Thibault
- Fonction : Auteur
Pauline Trémeaux
- Fonction : Auteur
Isabelle Claudet
- Fonction : Auteur
Mélanie Pucelle
- Fonction : Auteur
Laetitia Staes
- Fonction : Auteur
Camille Vellas
- Fonction : Auteur
Romain Carcenac
- Fonction : Auteur
Nicolas Veyrenche
- Fonction : Auteur
Jean-Sébastien Casalegno
- Fonction : Auteur
Alexandre Gaymard
- Fonction : Auteur
Jose Kombou
- Fonction : Auteur
Antonin Bal
- Fonction : Auteur
Stanislas Ogoudjobi
- Fonction : Auteur
Résumé
Background
Nirsevimab, a long-acting monoclonal antibody, has been approved for the prevention of respiratory syncytial virus (RSV) infection in infants. In France, more than 210 000 single doses were administered in infants younger than 1 year during the 2023–24 season. In this context, the selection and spread of escape variants might be a concern. Here, we aimed to characterise RSV associated with breakthrough infection.
Methods
We did a multicentre, national, observational study in France during the 2023–24 RSV season in RSV-infected infants (aged <1 year) who either received or did not receive a dose of nirsevimab before their first RSV season. We excluded infants with insufficient information about nirsevimab treatment or without parental consent. We used respiratory samples collected in each laboratory for full-length RSV RNA sequencing to analyse changes in the nirsevimab binding site Ø. We tested clinical RSV isolates for neutralisation by nirsevimab. We analysed F candidate substitutions by fusion-inhibition assay.
Findings
Of the 695 RSV infected infants, we analysed 545 (78%) full-length RSV genome sequences: 260 (48%) from nirsevimab-treated breakthrough infections (236 [91%] RSV-A and 24 [9%] RSV-B) and 285 (52%) from untreated RSV-infected infants (236 [83%] RSV-A and 49 [17%] RSV-B). Analysis of RSV-A did not reveal any substitution in site Ø known to be associated with resistance to nirsevimab. Two (8%) of 24 RSV-B breakthrough infections had resistance-associated substitutions: F:N208D (dominant resistance-associated substitution) and a newly described F:I64M plus F:K65R combination (minority resistance-associated substitution), both of which induced high levels of resistance in the fusion-inhibition assay.
Interpretation
This study is, to the best of our knowledge, the largest genotypic and phenotypic surveillance study of nirsevimab breakthrough infections to date. Nirsevimab breakthrough variants remain very rare despite the drug's widespread use. The detection of resistance-associated substitutions in the RSV-B F protein highlights the importance of active molecular surveillance.