Impact of the Ileal microbiota on surgical site infections in Crohn’s disease: a nationwide prospective cohort
2 LPSM (UMR_8001) - Laboratoire de Probabilités, Statistique et Modélisation
3 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
4 Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon]
5 INFINITE - Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286
6 CHLS - Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL]
7 CIRI-APY - Autophagie infection et immunité - Autophagy Infection Immunity [CIRI]
8 M2iSH - Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte
9 Service Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Clermont-Ferrand]
10 Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie]
11 PERITOX - Périnatalité et Risques Toxiques - UMR INERIS_I 1 UPJV
12 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
13 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
14 Hôpital Beaujon [AP-HP]
15 Hôpital Claude Huriez [Lille]
16 Service d'Oncologie Médicale [Centre hospitalier Lyon Sud - HCL]
17 CHU Clermont-Ferrand
18 Chirurgie digestive [CHU Amiens]
19 SSPC - Simplification des soins chez les patients complexes - UR UPJV 7518
20 FHU PaCeMM - FHU Paris Center for Microbiome Medicine
21 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
22 CHUGA - CHU de Grenoble-Alpes - Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble
23 Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP]
24 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
25 CHU Amiens-Picardie
26 CHIMERE - CHirurgie, IMagerie et REgénération tissulaire de l’extrémité céphalique - Caractérisation morphologique et fonctionnelle - UR UPJV 7516
27 HCL - Hospices Civils de Lyon
28 IP Paris - Institut Polytechnique de Paris
29 TSP - CITI - Département Communications, Images et Traitement de l'Information
30 TIPIC-SAMOVAR - Traitement de l'Information Pour Images et Communications
31 LBA UMR T24 - Laboratoire de Biomécanique Appliquée
32 MICALIS - MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé
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Résumé
Background and Aims Surgery is performed in 50–70% of Crohn’s disease [CD] patients, and its main risk is surgical site infection [SSI]. The microbiota has been extensively assessed in CD but not as a potential risk factor for septic morbidity. The objective of this study was to assess the impact of the gut microbiota on SSI in CD. Methods We used the multicentric REMIND prospective cohort to identify all patients who experienced SSI after ileocolonic resection for CD, defined as any postoperative local septic complication within 90 days after surgery: wound abscess, intra-abdominal collection, anastomotic leakage or enterocutaneous fistula. The mucosa-associated microbiota of the ileal resection specimen was analysed by 16S gene sequencing in 149 patients. The variable selection and prediction were performed with random forests [R package VSURF] on clinical and microbiotal data. The criterion of performance that we considered was the area under the Receiver Operating Characteristic [ROC] curve [AUC]. Results SSI occurred in 24 patients [16.1%], including 15 patients [10.1%] with major morbidity. There were no significant differences between patients with or without SSI regarding alpha and beta diversity. The top selected variables for the prediction of SSI were all microbiota-related. The maximum AUC [0.796] was obtained with a model including 14 genera, but an AUC of 0.78 had already been obtained with a model including only six genera [Hungatella, Epulopiscium, Fusobacterium, Ruminococcaceae_ucg_009, Actinomyces and Ralstonia]. Conclusion The gut microbiota has the potential to predict SSI after ileocolonic resection for CD. It might play a role in this frequent postoperative complication.
| Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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